30+重病原体检测的不二之选 —— PlexTaq

在PCR过程中,可能会出现非特异性DNA的合成或引物二聚体的形成,导致PCR反应的灵敏度和特异性不理想。此外,一般DNA聚合酶对于复杂的临床样本耐受性差,需要对核酸进行纯化后进行扩增。基于目前这些问题,Medix Biochemica推出一种新型的Taq DNA聚合酶突变体,在室温下稳定,并且对于复杂的临床样本具有超强的耐受能力。

货号

产品名称

规格

#1101

Taq Hotstart DNA Polymerase

400/4000 U

#4000

PlexTaq® 5x qPCR Multiplex Master Mix

100/500 reactions

 

01
通过人工定向设计DNA聚合酶突变,具有高特异性

为了获得一种能在PCR反应中具有更高特异性和灵敏度的热启动Taq DNA聚合酶,我们筛选了一个突变体,对DNA聚合酶进行结构鉴定,并对其突变进一步设计,使其仅在最佳PCR循环温度下具有活性 (图1)。

图1. 突变位于热启动Taq DNA聚合酶 α螺旋结构,

使酶在室温下失活

 

为了进一步改进聚合酶的热启动活性,设计一段用于结合酶活性位点的适配体,以热可逆的方式激活/阻断酶活性 (图2)。低温下当适配体与酶紧密结合时阻断酶活性,当温度高于55°C时,适配体脱落,从而释放酶活性。

图2. 适配体修饰热启动Taq DNA聚合酶

02
简化PCR试剂配置过程,具有室温稳定性

在PCR体系设置过程中,通常要求冰上或低温环境下操作。对于新型的热启动Taq DNA聚合酶,可以允许其在常温条件下操作,简化了PCR试剂配置的流程。

将新型的热启动Taq DNA聚合酶和野生型Taq DNA聚合酶进行对比。DNA模板浓度由1-0.001 ng/μL梯度稀释后,分别进行PCR扩增,并且两种酶同时于21°C条件下孵育6h后再次进行PCR扩增。新型的热启动Taq DNA聚合酶特异性表现良好,并且在21°C条件下孵育后,酶活性保持不变 (图3)。

图3. 新型热启动Taq DNA聚合酶

野生型Taq DNA聚合酶的扩增对比

03
更快速的多重病原体检测

经特别设计的新型热启动Taq DNA聚合酶不需要特别的激活步骤,可快速启动PCR扩增,使PCR整体反应时间减少。用于多重病原体扩增,设置不同的DNA模板浓度10000-10拷贝/反应 (内参基因浓度5000拷贝/反应),实验证明新型热启动Taq DNA聚合酶在相同扩增条件下可以更快得到可靠的多重检测结果 (图4)。

PlexTaq已经成功用于基于NGS方法进行30+重HLA分型检测和基于tNGS对于植物叶片进行30+个靶点检测。

图4. 新型热启动Taq DNA聚合酶于多重病原体检测的应用

04
更强耐受性用于血液直扩
这种新型热启动Taq DNA聚合酶表现出对常见PCR抑制物具有强耐受性。经EDTA抗凝剂处理的血液样本,不需要提取及纯化,以人类凝血风险因子5-SNP基因为靶点扩增,其对于血液样本的耐受性最高可达到20%的血液量 (图5)。

图5. 新型热启动Taq DNA聚合酶于血液样本检测的表现

 

 


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